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Los investigadores ahora pueden recolectar y secuenciar ADN del aire

Crédito de la imagen: Shutterstock

Dejamos ADN por todas partes, incluso en el aire, y por primera vez, los investigadores han recolectado ADN animal de meras muestras de aire, según un nuevo estudio.

El ADN el hecho de que los seres vivos, humanos y de otro tipo, arrojen al medio ambiente se llama ADN ambiental eDNA. La recolección de eDNA del agua para aprender sobre las especies que viven allí se ha vuelto bastante común, pero hasta ahora, nadie había intentado recolectar eDNA de animales.desde el aire.

"Lo que queríamos saber era si podíamos filtrar el eDNA del aire para rastrear la presencia de animales terrestres", dijo la autora del estudio Elizabeth Clare, ecóloga de la Universidad Queen Mary de Londres, en a resumen de video para el estudio, publicado el 31 de marzo en la revista PeerJ . "Estábamos interesados ​​en saber si podíamos usar este 'airDNA' como una forma de evaluar qué especies estaban presentes en una madriguera o una cueva donde no podríamos verlas o capturarlas fácilmente", agregó.

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Como experimento de prueba de concepto, Clare y sus colegas intentaron recolectar ADN del aire en una instalación para animales que alberga un organismo modelo, el rata topo desnuda . Los investigadores detectaron ADN humano y de rata topo en el aire tanto de los recintos de ratas topo como de la habitación donde se encuentran los recintos.

"La demostración de que el ADN de animales relativamente grandes también se puede detectar en muestras de aire amplía drásticamente el potencial para el análisis de eDNA en el aire", dijo Matthew Barnes, ecólogo de la Universidad Tecnológica de Texas, en Lubbock, que no participó en el nuevoestudio.

En la última década, la recopilación y el análisis de eDNA para estudiar y administrar las poblaciones de plantas y animales ha despegado, dijo Barnes. "La analogía que utilizo es como el detective en la escena del crimen, encontrando una colilla de cigarrillo y limpiándolapara que el ADN coloque al criminal en la escena del crimen. Lo hacemos con eDNA, excepto que, en lugar de buscar criminales, buscamos una especie rara o esquiva ", dijo Barnes. La especie podría estar en peligro de extinción o una especie invasora nueva paraun medio ambiente, dijo.

Antes de este estudio, algunos investigadores habían recolectado ADN de plantas del aire, pero la mayoría de esos experimentos involucraron plantas que "se esperaba que liberaran intencionalmente columnas de ADN en el aire en forma de polen y semillas en dispersión", dijo Barnes.Los animales, por otro lado, no hacen eso. "No teníamos idea de si esto funcionaría", dijo Clare a Rhythm89.

Pero si bien los animales no lanzan esporas de polen al aire, sí arrojan ADN en forma de saliva y células muertas de la piel, por ejemplo. Para ver si se podía recolectar el eDNA animal de estas fuentes, Clare y sus colegas aspiraron airede un recinto de ratas topo desnudas y de la habitación que alberga los recintos a través de filtros similares a los filtros HEPA que se encuentran comúnmente en los sistemas de calefacción y ventilación. Luego, los investigadores extrajeron el ADN de los filtros y lo secuenciaron. Para identificar la especie de la que provenía el ADN,los investigadores compararon las secuencias con secuencias de referencia en una base de datos.

El hallazgo de ADN humano dentro del recinto animal sorprendió al principio a los investigadores, dijo Clare a Rhythm89. Sin embargo, dado que los humanos se preocupan por las ratas topo, tenía sentido en retrospectiva, dijo Clare.

La presencia de ADN humano en casi todas las muestras del estudio es "un obstáculo importante", dijo Barnes. Por un lado, muestra de manera alentadora que el método de detección es sensible, dijo Barnes. Pero "esto también podría sugerir que las muestras en el aireson particularmente fáciles de contaminar con el ADN del equipo de investigación, especialmente cuando los mamíferos son el objetivo del análisis ", agregó.

Para evitar tal contaminación, los investigadores podrían tener que usar técnicas de sala limpia, como filtros de aire, batas y redecillas para el cabello, para evitar agregar su ADN a los entornos que están estudiando oa las muestras de ADN con las que están trabajando, dijo.

En el futuro, los científicos esperan usar la técnica para monitorear especies animales en viviendas de difícil acceso. "Puedo imaginarme metiendo un tubo en un gallinero o en un sistema de túneles y succionando el aire de ese sistema en lugar de tener queintenta rastrear a los animales para descubrir qué hay presente ", dijo Clare a Rhythm89.

También podría ser una buena forma de detectar especies que están presentes pero son raras en un entorno determinado, como un especie en peligro de extinción , agregó. Y podría ayudar a detectar una especie sin interactuar con ella, lo que podría tener ventajas, dijo Barnes. "[El método podría] darnos la oportunidad de buscar organismos sin tener que manipularlos y estresarlos," él dijo.

Si el análisis de eDNA permitiría a los científicos estimar el tamaño de la población, o la cantidad de animales que viven en una vivienda, es un tema de debate, pero Clare dijo que no cree que sea bueno para eso. "Hay demasiados pasos enel procedimiento que puede hacer que varíe la cantidad de ADN que se recolecta ", dijo.

Ahora Clare y sus colegas están estudiando qué tan lejos puede viajar el airDNA y cómo el tamaño del espacio afecta la cantidad de eDNA que se puede detectar, dijo Clare en el resumen del video.

Otro paso importante en el estudio del airDNA animal será tratar de recolectar airDNA de animales al aire libre, en lugar de hacerlo en un laboratorio de investigación, dijo Barnes.

Publicado originalmente en Rhythm89.